最后處理的，就是西班牙遠征軍中的兩名中國人，或者叫生理人，袁樸和吳雁鳴。這兩個人都是西班牙軍的向導，但做夢也想到，西班牙軍會敗得這么慘，竟然是全軍覆沒，一個也沒逃了。看著俘虜一批一批被審叛，有的釋放，有的做苦工，兩人也不由緊張起來。不知道會怎樣對待自己。
等商毅叫到兩人的名字時候，袁樸和吳雁鳴都嚇得全身發軟，一齊跪伏于地，痛哭流涕，給商毅叩頭不止，訖求僥命。
商毅道：“你們兩個都是中國人，為什么要幫西班牙人來攻打中國呢？”
袁樸忙道：“回稟大人，小人兩個都是在馬尼拉經商的生意人，本來也不愿幫洋鬼子侵犯天朝，只是妻兒老小，身家性命，全都掌握在干系臘人手里，也是迫不得己，還請大人明察呀。”
商毅點點頭，道：“按你們兩人的說法，到也算是情有可原，好吧，你們是被迫還是自愿，本官自會詳察，如果本官察明，你兩人是被迫，自然會將你們釋放，若是自愿，本官也絕不輕饒。不過在本官察明之前，暫時將你兩人監禁起來。”于是將他們和那二十名牧師關在一起。
其實商毅雖然不清楚真像，但也估計這兩人所說絕不是實情，他們肯定不會是被強迫，多半是被利誘，最多也是半迫半誘，因為一般來說，向導是不可能被強迫的。不過他們兩人和投降滿清的性質又有不同，主要是因為大明政府對南洋諸地釆用放任的措秩，拱手將自己昔日的附庸讓給了歐州人，在發生1603年的馬尼拉華人大屠殺之后，明朝政府的態度卻是不聞不問，甚致認為馬尼拉的華裔商人是咎由自取。也使南洋的商人在沒有祖國做依托的情況下，不得不屈從于歐州人的統治。
當然雖然有這些原因，商毅也不認為袁樸和吳雁鳴的做法就是可以原諒的，畢竟在民族國事大義面前，其他的私人利益必須放在其次的位置。這次西班牙入侵，同樣是馬尼拉商人，張庚秋選擇的卻是向官府通風報信，這就是區別。
不過商毅暫時不想處置他們，是因為殺他們再容易不過了，也就是一刀的事，但留著他們，說不定以后還有大用。當然前提是他們在馬尼拉不是充當給西班牙人助紂為虐的角色，這一點商毅打算找李格菲和張庚秋求證一下。如果他們只是一般商人那就算了，商毅還打算收為已用。
全部的俘虜也處理完了，商毅這才又命沈壽崇返回昌國衛，招集愿意正式加入商家軍的士兵，趕到杭州府去向自己報到。同時也將商家軍的士兵的侍遇、要求、條件和紀律都向沈壽崇做了詳細的說明，也讓他轉告給昌國衛的每一名士兵。
然后商毅才下令，讓周少桓先帶隊，撤軍回杭州府。自己和亞莉桑德拉一起，押送著所有的戰船，趕到船廠去。
商毅調集的戰船都停泊在紹興府的臨山衛，和船廠隔海相望。但繳獲的西班牙戰船有不少需要修整，另外商毅也希望將所有的西班牙戰船都做一些改進。
這到不是說西班牙帆船的性能有問題，而是因為在這個時代，西班牙帆船的臟亂，也是在歐州出了名的。這要要是一方面是因為西班牙帆船的船員較多，又要裝貨，結果造成空間狹小，擁擠。而另一方面，也是因為西班牙帆船在設計上有缺限，缺少衛生間、通風設施和排污渠道，結果導致衛生狀況極為惡劣，一般來說，除了船長或少數高級人員的房間和甲板表面稍好一些之外，船甲板下的空間，由其是一般船員和士兵的宿舍，幾乎就像地獄一樣，到處都是垃圾和各種昆蟲、老鼠。充滿了“地獄的氣息”和“惡魔的味道”。
在繳獲了戰船之后,商毅也只在“銀河戰艦”號上，下過一次甲板以下，就再也不敢去了，同時也不得不佩服，從西班牙趕到馬尼拉，至少要七八個月的時間，西班牙的士兵們是怎樣忍受這一切。整個這支艦隊，大概只有亞莉桑德拉的座船“海上玫瑰”號的衛生情況要稍好一些。因此在趕去船廠的途中，商毅放棄了乘坐“銀河戰艦”號，而是乘坐“海上玫瑰”號。
相比之下，荷蘭和英國的船，在這方面就要好得多了。因此荷蘭和英國取代西班牙成為海上的霸主，也不是偶然的。要知道這些細節看似與戰斗無關，但卻會極大影響士兵的情緒和士氣。
因此商毅要重點改造的就是每一條船的衛生設備和通風、排污糸統。商毅可不希望日后自己會乘做著充滿了惡臭的戰船，馳騁在碧海青天之間。
商毅對西班牙帆船的改造計劃，也得到了亞莉桑德拉的大力支持，因為女人比男人更愛干凈，她對西班牙帆船的臟亂早就深惡痛絕了。“海上玫瑰”號可是她逼著船員每天清掃，才能夠保持著清潔。而且她也極少蹬上其他的戰船，就是受不了別的戰船上的臟亂。
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等商毅帶著船隊到了造船廠之后，胡江濱也嚇了一跳，雖然他以有些習慣了商毅的大手筆，但沒想到商毅能夠一下弄來這么多西班牙式大帆船，而且幾乎都是一千料左右的大船，其中也有不少一千五百料的大船，還有兩艘估計應該是二千料的大船。
胡江濱也不禁激動萬分，雖然他在馬尼拉的造船廠里造過二千料的大船，但那時他只是一個普通的造船工人，頂多只是一個小工頭，付責的也僅僅是整條船的一些局部，而且西班牙人對造大船的技術管制的很嚴，很少給他能夠窺視全貌的機會。更不用說是讓他仔細的研究整條船的結構。只能靠胡江濱平時一點一點的觀察積累，然后自己匯總。但現在商毅一下子開來了五六十條船，自然是夠自己研究了。
因此胡江濱在碼頭上迎接商毅的時候，也禁不住伸長了脖子，向船上看去，看那樣子，仿佛恨不能馬上跑到船上去，里里外外都看一遍。
商毅看到他的樣子，也不禁笑道：“胡師傅，不要急，這船就在這里停著，你以后還有的是時間看。現在我還有事情要向你交待。”
胡江濱也覺有些不好意思，道：“讓大人見笑了。”
商毅簡單的將戰事向胡江濱說了一遍，胡江濱對戰事的過程并不關心，反正只要是打贏了就好，但得知商毅帶來了一百多名西班牙的造船工匠，而且他們都愿意在船廠做事，頓時雙眼放光，也把剛才急著看船的心理暫時放下。
這時商毅帶來的造船工匠，也陸陸續續從“海上玫瑰”號上下來，在來船廠的途中，商毅也向他們詳細的交待了船廠的情況。因此眾人都清楚，而且多少也有些新鮮和興奮感。
這批工匠的頭領叫米歇爾，商毅將他向胡江濱做了引見。因為胡江濱在馬尼拉干過事，也會一些簡單的西班牙語，由其是懂造船的術語，因此和米歇尓還能有一些交流。接著亞莉桑徳拉也下船，因為胡江濱以經聽商毅說過，知道這艘大船是屬于這個洋女人的，因此也對她十分恭敬。
隨后胡江濱帶著眾人參觀了現在建設中的船廠，雖然船廠一些設施都尚在建設中，這時整個船廠以經初俱規模，也看得出，這個船廠占地極大。連米歇爾也認為，即使是在歐州，這樣規模的船廠也不多見。不過現在一號船塢的坑體以經挖好了，正在砌石壁。胡江濱告訴商毅，開年之后，這個船塢就可以完全建好，開工造船了。造船工匠們都是內行人，一看就知道，這是造大船的船塢。因此眾人也對這座船廠也比較滿意。覺得能夠在這里工作也不錯。
而亞莉桑德拉也頗覺意外，看起來商毅確實是有意發展海上的力量。
看完船場之后，胡江濱也讓徒弟們去安排這批工匠的住宿，亞莉桑徳拉也回到“海上玫瑰”號休息。
商毅卻和胡江濱來到他的辦公室里，拿出了一卷圖紙，遞給胡江濱，道：“胡師傅，你先看看這樣的船。”
胡江濱打開圖紙，只見畫的是一種自己從未見過的船型，從所標尺寸看，全長七丈二尺，寬一丈八寸，深八尺四寸，到不是一條大船，估計也就是二百料左右。但整個船身極為細長，船首呈空心，略為高出，而且首部水線明顯向內凹，有一個長長而尖削的曲線剪刀型首柱向前突出著，同時整個甲板上幾乎沒有任何高突的建筑物，顯得整條船的線條極為平滑優美，因此可以想像，一但出海，船將幾乎貼著水面航行。
而且這艘船不僅是船型古怪，連帆蓬也與眾不同，和別的帆船相比，這艘船帆的面積明顯要大得多，而且是釆用三桅結構，其高度達船長之3/4，在沿船首柱向外伸有一斜杠，就可在首部多懸一些支索三角帆，有利于擴大撐帆的容量；在船之兩側還有外伸帆桁，可掛翼帆，更加大了帆的橫向外伸面積，使帆的橫向尺寸大大超過船寬。
胡江濱是造船的行家，雖然未見真船，但也能判斷出這艘船的性能來，內凹的船首形狀，在海上能劈浪前進以減小波浪阻力；空心船首使船在浪中便于抬首，提高了它在浪中的航向穩定性；而大面積寬幅度的帆，也有利于使風，這些措施，都是為了提高船速。只不過構思巧妙，是自己見所未見，聞所未聞的。
因此胡江濱道：“大人，這是誰設計出的船型。”
商毅微微一笑，并沒有正面回答設計者的問題,只道：“這叫飛剪船，現在我們先造這種船。”