隨著鄭氏集團的投降，對于永歷這個南明小朝廷來說，打擊是非常巨大的，他們徹底失去了一個巨大的助力，而且海上隨著鄭氏集團的投降之后，也掐斷了他們繼續在海上獲取財源的可能性。
而大中朝在解決了福建鄭氏集團這個大麻煩之后，更是騰出了更多的兵力調入到了廣東開始對永歷小朝廷發動了攻勢。
永歷小朝廷的軍隊在大中軍的猛烈進攻之下，只能是節節敗退，不斷的將他們控制的地盤丟掉，先是整個廣東被大中軍攻占，進而大中軍在年底之前，又攻入到了廣西境內。
永歷帝眼看廣西不保，于是只得繼續逃竄，轉而在過年的時候，逃入到了云南境內，使得大中軍在天元三年二月的時候，便控制住了廣西全境，將整個永歷小朝廷的勢力范圍壓縮到了小小的云南境內，使得永歷小朝廷江河日下，再也無力反抗了。
而肖天健在天元三年三月，下令調集善于在山地作戰的各路人馬共十萬余人，對云南永歷小朝廷發動了最后一擊，各路人馬兵分三路，從廣西、貴州、四川三地開始進兵云南。
永歷小朝廷的軍隊根本無法抵抗兵強馬壯的大中軍，而且云南各地土司也都接到了大中朝的圣諭，告知他們只要投順大中朝，今后對于他們這些土司會寬以對待，否則的話，大中軍一到，必令其灰飛煙滅。
這些土司也都不傻，眼巴前看著大明已經完了，僅剩下永歷小朝廷還在最后進行著微弱的抵抗，在云南茍延殘喘，大中軍兵勢之強，也讓他們根本無法與之相抗，與其跟著永歷小朝廷，在大中軍來了之后被滅族，倒還不如倒戈趕緊找一條出路，對于中原王朝的更迭對于他們這些土司來說，影響不算是太大，只要他們表示順服，今后便還可以繼續給大中朝打工，所以云南各地土司在這個時候也紛紛宣布投順大中朝，并且集結土兵，幫著大中軍對付永歷小朝廷的軍隊。
結果是短短三個月的時間，永歷小朝廷的軍隊便紛紛被大中軍擊潰，降的降死的死，永歷帝也不得不卷鋪蓋繼續走人，眼看著中國境內已經基本上都被大中朝控制，他已經是逃無可逃，于是永歷帝便在幾百名忠心耿耿的侍衛的保護之下，從云南逃入到了緬甸王國境內。
大中朝天元三年五月，云南宣布全境歸服大中朝，至此肖天健的大中朝也完成了對整個南方的控制，包括海南島在內，五月間大批大中軍海軍在雷州出發，渡海在海南島登陸，海南島上的瓊州府三州十三縣的官員心知無力反抗，于是一個月不到的時間，便紛紛宣布歸降大中朝，接受大中朝的統治。
消息傳到南京城之后，朝野頓時一片歡騰，每個人都長長的松了一口氣，奔走相慶，慶賀大中朝自此之后，總算是可以安穩下來了。
肖天健得知云南和海南島都被收復的消息之后，也立即開懷大笑了起來，當即便在宮中設宴慶祝，當晚險一些喝的酩酊大醉。
他之所以這么高興，除了收復了整個南方諸省，平定了永歷之亂以外，還有幾件事情讓他非常高興。
一個就是去年他下旨籌建的大中朝南京太學院在年后終于在南京城外落成開始授課，第一批從全國各地遴選出了近八百名學子入學，成為了歷朝歷代規模最大的一次太學招生，而且今后每年還會繼續從全國招錄同樣數量的學子入學，學制四年，四年之后太學的生員數量將會達到三千人的規模，雖然這比起后世任何一座三流大學的學生數量都要少，但是這畢竟是剛剛起步，下一步北京太學院也將開課，招錄學子數量也會達到數百人之多，再有幾年時間，大中朝缺乏合適官員和專業人才的情況便會大幅緩解下來，為中國今后的興盛打下了基礎。
二一個好消息就是在經過半年時間的籌備之后，中國海上貿易集團正式在廣州府成立了起來，按照肖天健當初和鄭芝龍約定的條件，朝廷戶部要拿出一些股本投入到集團公司之中，但是戶部眼下到處都是用錢的地方，根本無法一下便撥出這么多資金投入進去，于是在肖天健的授意之下，戶部通過發行高利率債卷募集資金，輕松便募集到了三百萬兩白銀，折合成大龍銀元也就是三百萬元，另外投入各種海船一百五十余條，加上廣州、潮州、泉州、溫州、寧波、松江府、膠州、登州八處開埠所需的港口碼頭所需用地，通過折算之后，作為國家股本投入到了貿易集團之中，再加上鄭家三百萬兩白銀和一百二十條海船入股，以及另外共一百二十個商賈共同入股的五百萬兩白銀還有各種海船一百五十余條，共同撐起了這個中國歷史上第一個官私合辦的集團公司，宣布開始營業！
而且戶部所轄的海關總署也在年前成立起來，負責管理各地開埠港口進出口貿易事務，而且大中朝下旨宣布禁止一切私人船只，從其它港口出海行商，必須要經過設在這八個商埠的海上貿易集團公司來對進出口貿易進行統一管理，并且接受各地海關的檢查審核，繳納稅金之后，方可進行交易，而且宣布葡人所占據的澳門為非法商埠，任何中國商人都不得再繼續在澳門和洋人進行商品交易。
所有洋人必須要通過各個商埠，和大中朝進行進出口貿易的交易，否則的話變為非法，大中朝海軍一旦發現有人私下靠泊非通商商埠進行貿易的船只，有權查扣船只，抓捕違法之人。
通過這樣的手段，將整個中國對外貿易統一管理起來，如此一來大中朝今后單單是商埠海關收取的稅金一項，就會是一個天文數字，而且隨著海上貿易的擴展，今后這樣的收入會越來越高，這還不算貿易集團之中國家股本帶來的收入，今后大中朝單是在海貿這一項上的收入，恐怕每年最少也要達到千萬兩白銀以上，而且還會呈幾何增長越來越高，粗算一下之后，戶部的官員們的嘴巴險一些都笑歪了，今后他們總算不用天天再為扣著算著花錢發愁了。
再者就是通過各大船廠的努力，那些來自歐洲的造船工匠們在高額的薪酬之下，也沒有藏著掖著，通過半年多的努力之后，不但將早期建造的兩條西式三桅帆船建成下水，而且還在船廠的大力配合之下，加上已經跟著他們學習了大半年的大批中國工匠們業已熟悉了西式帆船的建造方法，他們在南京造船廠和寧波造船廠同時開工建造了四條排水量在五百噸左右的新式加利恩帆船。
這幾條帆船之中的一條也剛剛在南京造船廠建成下水，肖天健作為中國皇帝，得知消息之后，親自前往南京中華造船廠為這條船主持了下水儀式，甚至于按照中國傳統，還請來了僧侶為這條船進行了一次祈福。
這種加利恩帆船正是眼下歐洲海上列國裝備眾多的一種優秀的海船，船體比起克拉克帆船更狹長一些，降低了船首和船尾的船樓高度，提高了船只在惡劣海況之下的穩定度，而且隨著船身長寬比的加大，使得兩舷可布置的火炮更多，在海上的航速也加快了許多，西方人正是用這種船來往于歐洲和東方乃至是世界各地，同時也用這種船作為戰艦，爭奪海上的利益。
而南京中華造船廠所建的這艘加利恩帆船，可以同時裝載二十門二十四磅炮和十二門十二磅炮，在船首船尾處還可以另外承載幾門小型的佛朗機炮，作為對付小船的一種手段，起碼在這個時代的中國，這條船暫時沒有敵手了。
只可惜的是這種船因為建造的時候，因為中國不產橡木，能作為替代品的柞木也沒有大料，所以只能用其它木料替代，而且前期因為在鄭家投降之前，沒有打通海上通道，也無法大量從南洋采購進來優質木材，所以臨時作為替代品使用的多為在本地可以找到的樟木、松木和杉木，如此一來，在堅固程度上可能暫時還沒有辦法和歐洲采用橡木制造的戰船相媲美。
但是即便如此，肖天健看罷了這種新式的西式加利恩帆船之后，心中也非常高興，他現在最重要的是先讓中國的造船工匠們學會建造西式帆船，從中掌握西方國家最先進的造船技術，至于木材問題，今后逐步通過從南洋采購和解決掉建奴之后，從東北也可以解決，今后這都不是什么大問題，只要他堅持對造船業不斷的加大投入，想來以中國眼下的財力物力和人力，很快便可以建造出大批這樣的優秀海船。
于是他親自為這條船取名為“搏浪號”，希望此船今后能載著中國人遠帆大洋之上，搏擊風浪，為中華開創一個大海上的新紀元。
除了這些好事之外，機器制造廠那邊也傳來了好消息，肖天健親自主持設計的幾種水力機床，除了最早的鏜床之外，現如今車床、刨床和沖床，在歷經多次試制失敗之后，也都在天元三年頭幾個月之中取得了突破性的成功，開始能投入使用了，只差銑床目前還在繼續試驗之中，尚未最后取得成功，不過初步判斷，離成功也不算遠了。
這些水力機床的試制成功，對于今后大中朝的工業化發展無疑將會起到重大的作用，使得大中朝起碼在機械制造業方面，已經站在了這個時空技術的最前沿。
雖說現在這些尚有些原始的機床存在的問題還很多，特別是零件精度不夠，質量也因為材料的原因不能很好的得到保證，但是今后隨著冶煉業的發展，材料也會越來越好，加上這些原型機床的投入使用，用機械取代手工來對這些機械進行復制，之后所制成的零件精度也會越來越好，這樣一來，用不了多少年，大量的機床便可以投入到各個產業之中發揮作用了。
除了這些好消息一個接著一個的到來之外，肖天健的家里面也傳出了好消息，范靈兒在生下了肖天健第一個女兒之后，于年前再次承受雨露花開結果，再一次懷上了孩子，而且范雨桐也在年后也又為肖天健懷上了孩子，這一下他肖天健的家最晚在年底之前，便又要添新丁了，對于生孩子這件事上，肖天健現在可沒有什么想計劃生育的念頭，是來者不拒多多益善，他在這個時空之中，根本沒有什么親人，有的只是這三個妻妾，現如今這三個妻妾各個為他生下了兒女，這便是他最親的人了，所以范靈兒和范雨桐的再次懷孕，讓他高興的合不攏嘴。
現如今永歷之亂業已平定，整個南方諸省都歸于了他大中朝的統治之下，雖說各地尚會時不時的有一些大明余孽跳出來搗亂，可是在萬眾思安的大趨勢之下，這些試圖恢復大明統治的家伙不過只是些跳梁小丑罷了，面對著大中朝強力的鎮壓，各個都飛速的灰飛煙滅，連一點大點的水花都沒有能掀起來，這大明是如何都翻不了身了，這讓肖天健如何不高興呢？
于是這才有了肖天健在南京大宴群臣，喝了個東倒西歪的事情發生，如果不是侍衛和內閣大臣照應著，肖天健保不準便會當場出糗了。
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