一場水戰打破一個不敗神話，證明所謂的無敵神將織田信長也不過如此，原先還對不敗強者心存畏懼的武士紛紛騷動起來，心里想著這兩三個月橫掃畿內的武家莫非是個大水貨，只是運氣好恰好戳破六角家這個紙老虎，又一路復制前面的把戲，硬生生把三好家給嚇跑回四國，基于這種猜想便激起許多畿內武士的勃勃野心。
首先掀起反抗織田家的則是昔日美濃國的國主齋藤龍興，此君自從稻葉山城一敗涂地，逃亡長島城避難又輾轉來到畿內依附在三好義繼配下做客將，日子過的不好不壞也就混口飯吃，身為亡國之主心里總想著有朝一日回到家鄉奪回基業，所以此人這些年一直從事反織田的偉大事業，積極鼓動三好家與織田家為敵，都沒有成功。
去歲織田家突然擁立將軍西進上洛，一路威風八面橫掃千軍端的威猛無比，陷入內亂的三好家也在這場退潮中成為主要犧牲品，三好三人眾與三好義繼先后逃逸，松永久秀舉家降服，齋藤龍興這個姥姥不疼舅舅不愛的客將就留在堺町繼續蟄伏待機。
這一等還真讓他等到機會來，好大喜功的織田信長沒有選擇隱忍一時先穩固畿內的基業，而是很快聯合同樣好大喜功的足利義昭、二條晴良，參與到廢立天皇清洗朝臣的政變漩渦之中，一時間畿內風云突變，足利義昭這就要和親族足利義時對掐起來。
織田信長盡起畿內大軍攻擊坂本，甚至把防衛海岸線的織田水軍趁熱鬧鉆進內河攻擊坂本港，等于放空整個大阪海灣的漫長海岸線，三好軍的第一批登陸軍勢就在這個背景下悄悄乘船登上攝津國的土地，這次重返攝津的行動非常謹慎小心，生怕一朝不慎招來滿盤皆輸的局面，只拍來五百軍勢作為先鋒進駐攝津國，負責接應的便是這位齋藤龍興。
直到琵琶湖水戰結束的時候，齋藤龍興才接引過第二批五百軍勢。得知織田水軍自總大將九鬼嘉隆以下全員覆滅無一人生還，興奮的連夜寫信寄給正在阿波國待機的三好義繼，勸說他立刻率軍回援進內同參大業，第二天一早，齋藤龍興就揭起反旗，率領一千兩百軍勢對攝津國親織田的領地發起攻擊。
攝津大亂完全出乎織田信長的預料之外，更糟糕的是三好三人眾與三好義繼卷土重來。雖然他們只從四國帶回來七千軍勢，可就這七千軍勢匯合齋藤龍興所部，就是一股可以左右攝津國歸屬的巨大軍事武裝。
憑著多年舊部的感召，以及三好家正牌子家督的影響力，攝津國人眾反水倒戈的不在少數，池田勝正就在譜代家老荒木村重的慫恿下再次里切。伊丹親興這種來回切換從屬勢力的武家更是早一步宣布投降，足利義昭任命的攝津守護和田惟政被攆出攝津國，短短的半個月不到，攝津國再次易手。
接著反叛的自然是窩在甲賀山區里做山大王的六角承禎、六角義治父子倆，本來冬天的物產就很不豐富，甲賀山區這個窮山溝里更是窮的叮當響，吃糠咽菜熬過一整個冬天。好不容易盼到機會當然要插一杠子，當然以六角家那五百軍勢的實力，也就喊喊口號過個嘴癮。
始終敵對松永久秀的筒井順慶也在造反，織田信長許諾給松永久秀的特權是大和一國隨意切取，筒井家以及背后的南都六宗和興福寺能同意才奇怪，突然宣布要收回失去的領地，便對松永久秀所掌握的部分領地發起攻擊。
最后一個鬧騰最厲害的是畠山高政，去年關東將軍府得知畿內的局勢。就讓屬實畠山高政的本多時正給他寫一封長信，勸說他里切到關東公方的陣營里為足利義輝報仇，順便附上的是錢屋開具的三萬貫文永樂錢存票一張，在堺町隨時可以提取獻金，或者換取等價的軍械糧草武器等必備品。
不知是被他的義正詞嚴給打動，還是單純的看在錢的面子上，畠山高政很爽快的答應下來。半個月不到就拉起河內國人眾、紀伊根來眾兩萬軍勢聚眾作亂，這下可了不得，畠山高政的名聲太響骨頭太硬，出了名的反三好斗士突然變成反織田。這下畿內國人眾的臉色就更加精彩了。
后方掀起多長叛亂，迫使織田信長的坂本攻略胎死腹中，于是這位近畿霸主很不義氣的拋棄盟友淺井長政與朝倉義景，帶著軍勢揮師西進對攝津國、河內國的叛亂展開新一輪軍事治壓，坂本城的重重圍困很自然的解除掉。
坐鎮京都的足利義昭急的直上火，一封封信箋催促織田信長趕快回軍攻打坂本城，他已經知道正親町上皇不打算向遠國避難，只要攻陷坂本搶回上皇再收回那封院宣，足利義時依然是天下共討的兇徒惡賊。
只可惜織田信長根本不甩他，一個空殼子將軍對軍政兩道完全不懂，一門心思想打坂本討伐足利義時，坂本那么好打他又怎會吃一場敗仗，就因為這場敗仗搞的畿內四處起火，他心底有多郁悶誰知道，就在織田信長揮師西進的第二天，朝倉義景與淺井長政親自來到京都哭訴，織田信長欺騙盟友拋棄友軍罪莫大焉，請求公方殿下為他們做主。
足利義昭耐心的了解情況，發現這事的起因是攝津、河內、大和國的叛亂爆發，織田信長擔心后方有難就揮師西進，只留下一道口令傳遞給北路進軍中的淺井、朝倉聯軍，隨后把南近江的軍勢全部撤走。
織田信長的突然那決斷可把這兩家給閃個不輕，織田軍撤退的時候他們還在猛攻高島郡，待他們收到這條口令的時候，中條時秀帶著兩萬大軍怒氣沖沖的掩殺過來，要不是反應好速度快就要把這條小命交代在高島郡。
足利義昭耐心的聽完他們的哭訴，大概知道這是怎么一回事，無奈他手里連個大頭兵都沒有，明智光秀那個二五仔投靠織田信長差點把他給氣死，偏偏他這個空頭將軍還要維護副將軍的名譽以及合法性，有些不情愿的勸慰幾句不驕不餒，終有勝利的一刻云云就把他們給打發回去。
作為幕府將軍被副將軍屢次無視，又被配下大名一狀告到御所里，足利義昭的心情非常差，要不是關東的足利義時虎視眈眈讓人臥榻難睡，他一定會好好的教訓這個狂妄的家伙，究其原因還是畿內的大好局勢突生波折，順風順水時隱患被三言兩語壓下來，現在逆風逆勢就出現難以彌補的裂痕。
足利義昭的心情非常差，他發覺自從離開興福寺一乘院以來，仿佛做什么事情都是錯誤的，任何惡事都能沾到他的身上，漸漸的民間傳說里也把這位幕府公方稱之為惡公方，上以為稱呼為惡的是被殺頭的惡御所足利義教，民間這么謠傳的惡意十足。
惱恨運氣不好頻頻倒霉，好端端的畿內被攪合的四處漏雨，卻不想他是踩著他兄長的尸體當上將軍，一味的怨恨別人不給他施展才華的機會，讓他得以創造一個理想中的完美幕府體系，七拐八拐就拐到怨恨足利義時，沒有他就不會有坂本的慘敗，他也不會有現在的煩惱，遷怒的角度堪稱刁鉆。
在攝津平亂的織田信長忽然匆匆返回京都，他帶來一個非常糟糕的消息，毗鄰自己老巢岐阜的飛騨國、信濃國傳出巨大的動靜，北陸道加賀國、越中方向也有軍事異動，畠山家也在這個時候掀起動亂，傀儡家督畠山義綱的長續連被殺。
能登守護畠山義綱在永祿九年失權，能登畠山家的首席家老溫井家在弘治之亂被驅逐，家中的大權便被七人眾的另外六家把持，這六家的魁首就是以長續連、游佐續光這二人，他們倆是義兄弟關系，游佐續光迎娶長續連的妹妹為妻，大舅哥和妹夫的意思。
但是這兩人的關系非常惡劣，因為長續連是堅定的反關東公方，而游佐續光則主張親關東公方，兩人的矛盾異常激烈，并導致一個月前，游佐續光引發暗殺大舅哥長續連的事件，這一事件讓本不安穩的能登畠山家又一次經歷大亂，長續連的嫡子長連龍試圖反擊，無奈寡不敵眾只有棄城而逃，這一逃就輾轉逃到織田家尋求庇護。
繼北陸道、飛騨、信濃國出現軍事異動以來，關東也傳來異樣的軍事動作，據常年行走羽奧線路的商人傳聞，羽奧的各大港口幾乎同一時間戒嚴，各地城下町不約而同的施行宵禁，各地發布的軍役募集書狀張貼在村頭巷尾，警固眾、同心眾如林大敵的警惕各地的騷動。
這些都不重要，起碼對比下一條消息不算問題，足利義時高調宣布奉正親町上皇院宣，舉東國之兵上洛入京，叩天門！(