極度濃縮的源能精華在手，事情的發展當然沒有什么懸念，五個超級文明一統星空，正式成立了大聯邦。
這時，擁有源能精華的人，地位已經飛速躥升了，大聯邦的領導人當然也要從這十二個人里面產生了，要不然，大家都懂的。
沈鶴程原本就是其中一個超級文明的實權派，有豐富的從政經驗，當選為聯邦總理，主要負責各級政府和財政支出，相當于大聯邦排名第二的領導人。
功勛卓著的戰皓成為大家都服氣的聯邦統帥，主要負責聯邦軍事和社會穩定，相當于大聯邦排名第三的領導人。
原先只在科技文化領域享有盛名的杜令海，由于源能之心的加成，大大提升了軍事科技，隱隱成為所屬超級文明的實際執掌者，順理成章地走上了政壇，成為聯邦執政官，主要負責社會進步和經濟發展，相當于大聯邦排名第四的領導人。
另一枚源能之心的擁有者，是五個超級文明中唯一一個原先擔任總統的，上位者的號召力非他人可比。聯邦主席作為聯邦的最高當權者，負責拍板定音和簽署命令，這個大聯邦排名第一的領導人位子就非他莫屬了。
擁有源能之幔的佼佼者，成為聯邦政議院議長，主要負責法律法規、行政監管和表決重大事務，相當于大聯邦排名第五的領導人。
以上，等于五個超級文明中各有一人在大聯邦的新政權里擔任要職。
戰鋼、杜夢因為已經有長輩擔任要職，而且當時他們二人都年幼，只能掛名為政議院的議員。
其他五個源能之幔、源能之殼的擁有者，分別進入主席辦公室、總理辦公室、戰略辦公室、參謀處、太空防御司令部等重要部門任職一把手，以起到權力平衡、互相監督的作用。
剛開始的那些年，還算是風平浪靜，十幾年后，一些弊端就開始顯現了。
比如說，雖然大家從表面上看都身處大聯邦的懷抱中，但物以類聚、人以群分，不可能融合的那么徹底。明眼人都看的出來，那五個超級文明的利益遠高于其他文明，這讓原屬于其他文明的人們頗有微詞，卻也只能壓著、憋著，像是一直在蓄勢的火山。
其實這也沒什么難以理解的，大家都清楚大聯邦是打出來的，有點像秦始皇統一六國，大聯邦的中央集權制也不太穩。
另一方面，五個超級文明之間也出現了裂痕，比如說有的急需哪一方面的發展，想得到足夠的資源傾斜，卻沒有完全如意。有的覺得自己這邊貢獻最多，投入和收益不成比例，開始截留本應上繳的利益。
多種原因，導致大聯邦出現貌合神離的現象，本已融合的各個文明，有了明里暗里拉幫結伙的現象。
只有戰皓牢牢把控著軍事力量的重點部門，不和任何一方深談，反正再怎么往壞里發展，也沒人敢和他叫板。
杜令海加大了嫡系力量軍事科技的投入，并以軍事科技做籌碼，和一些原有的超級文明實權派不斷達成新的合作。可以說，如果大聯邦解體，杜令海能在第一時間組成縮小版的聯邦，最大限度地穩定局面，不至于一片混亂。
杜令海的頻繁動作，被一些人解讀成為了保障自己的利益，竟然加速了其他超級文明拉幫結伙的進程。
聯邦主席更是焦急難耐，因為大聯邦解體后，他的優越感將蕩然無存。而且，他原先所屬的超級文明，在軍事上相對來說弱于其他四個共同執政的超級文明，大聯邦解體后的處境可想而知。
于是，他利用還在職的便利，瘋狂簽署發展人工智能的命令，想讓自己原先所屬的超級文明擁有一支龐大的人工智能戰隊。
因為發展的倉促，有些失衡，導致大批人工智能的缺陷只是被掩蓋，而沒有被修復。在一次處理緊急事故時，由于現場的背景圖形和提前輸入的有偏差而識別錯誤，竟然引發了反復識別無效的無限次操作，那些機器人無法理解圖形為什么有偏差，無法證明自己的運算是否正確，最終邏輯崩潰。
要命的是，像是被傳染了一樣，邏輯崩潰迅速演化為集體性的，那可是數以萬計的無法控制的瘋子機器人，成為整個大聯邦的噩夢。
事件平息下來后，大聯邦主席引咎辭職，卻沒停止發展人工智能的野心，但不想繼續動用資源儲備被詬病，就一意孤行地親自帶人去遙遠的星域探索生產超能機器人的礦源。在抽取沿路恒星的星核作為能量時，卻因為二次抽取，發生了意外。
根據即時發回的信息，應該是抽取上一顆恒星能量時，沒計算好行星發生碰撞后的運動軌跡，導致了相鄰的星系交錯。
為了避免被星系引力場的潮汐力扯碎，當時只能暫停抽取第二顆恒星的星核能量，緊急避險。之后二次抽取的時候，那顆被抽取了大部分星核能量的如同進入老年期的恒星突然發生了爆炸，他們沒能躲開，全軍覆沒。
大聯邦主席的逝去，使大聯邦已經顯得微妙的平衡被徹底打破，因為伴隨著他消失的，還有那枚源能之心。
各位領導人難以取得一致，而且互不服氣，大聯邦主席的位置一直空缺。
各自為政、擁兵自重、明哲保身、各保實力等現象就越來越嚴重，整個大聯邦進入了動蕩的列國時代，只不過誰也不想承擔分裂聯邦的壞名聲，都不肯撕下偽善的面具。
不想讓大聯邦陷入戰爭泥潭的沈鶴程疲于奔命，卻無力回天，只能舍出多年的面子打交際牌，并廣撒錢糧，維持一天算一天。
由杜令海主導、杜夢負責的意識遷移項目“聯邦方舟”被曝光，成了大聯邦隕滅的導火索。
整個大聯邦都在瘋傳，杜令海自身擁有源能之心，杜夢擁有源能之殼，他們聯合了擁有源能之心的戰皓、擁有源能之幔的戰鋼爺孫倆，秘密打造了“聯邦方舟”多維空間樹，復制、拓印了大聯邦政治、經濟、軍事、科技等方面的優秀人才的記憶和意識腦區，意圖毀滅現有的大聯邦，利用那些記憶和意識腦區，通過源能之心、源能之幔、源能之殼的三者結合，重建由他們主導的大聯邦。