夢雅離開了，輪回者也沒有你要繼續呆下去，海軍與海盜雙方的主線陣營任務均已經失敗，雖然還是互相看不順眼，但也沒有必要繼續的戰斗下去。
不過他們之間的戰斗結束了，這個世界卻被搞得一團糟，皇城被毀，秩序崩壞，再加上四處神出鬼沒的異形，不知不覺間這個世界已經亂的不像樣。
發現這樣的情況，李煜也很惆悵的嘆了口氣，他的任務是塑造一個新的秩序，而不是打破秩序，把這里搞得一團混亂。
接下來又有得忙了。
任務結束，姜瀾和洛卡先后選擇回歸，彼得被李煜抹去了意識，丟到伊魯斯那里被研究，鄭雄去往深海準備尋找可以作為玄武圖騰的載體海龜。
一時間，海面上只剩下了李煜和漢克斯，他們兩個的任務比較特殊，都需要時間來慢慢達成。
“合作吧！我們的任務沒有沖突，可以同時完成。”李煜找到漢克斯說的。
“我會在這里再待幾年的時間，期間我會海洋為據點，大量研究并強化我的異形，五年以后我會讓他們周期性的進攻陸地。你應該知道，最能刺激科技進步的就是戰爭，我會讓異形控制進攻強度，給人類文明帶來壓力，同時又不會毀滅他們，相信在這種情況下，你的任務也可以很快達成。”
這是一個兩全其美的合作方法，李煜在這段時間可以安心的讓伊魯斯尋找到最適合異形的進化路線，同時也可以消化自身的實力變化。
漢克斯有了充足的時間緩沖，在這段時間內他和他的塞伯坦機器人可以掀起工業革命，給世界的科技帶來沖擊性變革。
“沒有問題，不過需要隨著時間逐漸調整具體方案，我需要至少五年的時間來建設工業基礎。”漢克斯在運算了幾秒后，同意了李煜的合作方案。
確立了合作意向，李煜和漢克斯各自離去，做自己該做的事情。
李煜回到了他的小島上，來到伊魯斯的實驗室中，準備共同商議幾年的研究方向。
根據伊魯斯的建議，接下來這段時間他會優先培養出一種可與異形共生的菌類，這些菌類可以通過光合作用等方式為異形提供能量，并在需要的時候成為異形的得力武器。
其次，伊魯斯在彼得的身體中提取出了大量的rc細胞，并找到了一些吸血鬼血脈中的魔法因子，準備以此為基礎破解雷霆巨龍體內的神性。
最后，伊魯斯會使用余下的時間來優化異形的社會結構，包括但不限于異形皇后的統治與繁殖方式，異形巢穴的基本結構等等。
這些每一個都是十分復雜的工作，需要漫長的時間來研究。
不知不覺之間，五年的時光流去，這個世界變成另一番模樣。
這五年間，李煜一邊配合伊魯斯的研究，一邊帶領著小島在全世界飄蕩，尋找那些海洋深處，沙漠里，森林中有價值的生物基因樣本。
在尋找基因樣本的同時，李煜會每隔一段距離留下一部分異形，讓他們在原地建造巢穴，就地繁衍生息。
如今，已經有幾十處形成規模的異形巢穴在世界各地蠢蠢欲動，只要李煜下令便可以向陸地上的人類展開攻擊。
伊魯斯成功研制出了一代異形附屬菌類，因為在實驗過程中受到小黃人的影響，這種菌類平時的菌落表現為黑色，在營養充分的環境下會結成黃色圓柱狀個體。
這些菌類可以在陽光，黑暗，有氧，無氧等各種極端條件下生活，并可以像病毒一般以及快的速度分裂，將環境改變為異形生活的最佳環境。
這種菌類大量的存在于每一個異形巢穴之中，這些菌落中會共生許多具有強烈的治病性病毒與細菌，是任何非異形生命的夢魘。
而另一邊漢克斯的改造也很成功，他和他創造的塞伯坦人被這個時代的人們喻為神明，行事基本上沒有阻礙，工業革命進行的異常順利。
僅僅是五年的時間，這里的科技水平已經發展到了接近19世紀末，不過這種程度已經是極限了，并不是所有人都能跟得上這種速度的科技發展。
這些年間爆發的科技已經甩開了太多跟不上時代變化的人，能夠適應目前生活的人口不到10，絕大多數人都因為突然爆炸的科技而感到迷茫。
很多人甚至選擇躲到了深山老林之中避世生活，在他們看來那些復雜的機器更像是吃人的怪物，和異形一樣恐怖的怪物。
短時間內科技的發展已經走到了極限，漢克斯與李煜商議后，決定展開第一輪入侵戰爭。
在雙方都有了一定的基礎，首次戰爭爆發，一眼望不到邊際的異形從世界各個角落中出現，在極短的時間內摧毀了數個人類國家，不斷地壓縮著人類的生存空間。
人類一邊也在漢克斯的指揮下迅速反應過來，積極響應戰斗，建立防御基地，拿出武器開始反擊。
在異形帶來的的壓力下，人類文明的壁壘不復存在。在漢克斯的潛在推動下，為了生存全人類不得不聯系合在一起，前所未有的大型聯合國家誕生。
在這以后，持續了數個世紀的戰斗打響，生活在海里的異形與人類開始永無止境的戰爭，彼此之間帶來壓力，迫使雙方不斷的進步。
在李煜和漢克斯的有意控制下，人類和異形互有勝負，沒有出現一方被碾壓的情況。
隨著時間的推移，即使不再需要二者插手，異形與人類之間也可以形成穩定的循環。
新的秩序確立，科技也在異形壓迫下迅速發展，不知不覺雙方都已經完成了自己的陣營任務。
鄭雄要在這段時間里找到了一只變異的大海龜，這家伙運氣好得到了一部分亞特蘭蒂斯的遺產，不僅長的特別大，還可以一定程度的控制水元素。
把這只海龜抓回來后，鄭雄和漢克斯一同選擇離開，李煜也等伊魯斯處理過剩下的研究成果后返回到了輪回空間中。