長生首先施展別天神，想要強行更改大蛇丸的意志，以此達到不戰而屈人之兵的目的，不料大蛇丸此刻不僅成為十尾人柱力，還擁有一雙輪回眼，實力早已達到六道層次，憑借長生眼那點瞳力施展出來的別天神，根本無法影響到大蛇丸。
別天神失敗后，大蛇丸命令柱間、斑、日向天忍等人聯合圍剿長生，長生將封印術與刀術相結合，一刀一個將眾人統統封印。
長生緊接著施展刀之領域，欲瞬息之間斬殺大蛇丸，不料大蛇丸憑借輪回眼的瞳力看清了長生的出刀軌跡，用求道玉凝聚成天之矛，阻擋下長生的刀之領域。
兩人一個揮刀一個揮矛，轟轟烈烈搏殺在一起，每一擊的威力都足以翻江倒海，一時間戰場上天崩地裂日月無光，一派末世降臨的景象。
長生被逼無奈，將當初本體封印在左眼里的殘余長生眼的瞳力，統統發揮，施展出金輪轉生爆，再將刀之領域與金輪轉生爆相結合，斬出曠古絕世的一刀，將大蛇丸腰斬當場，剜掉他的輪回眼。
大蛇丸臨死之際將封印在月球中的大筒木輝夜釋放出來，無限月讀啟動，月光籠罩而下，神樹瘋狂生長，忍界所有被月光照耀到的人統統被綁成木乃伊吊在神樹上，陷入無限月讀世界。
長生將從大蛇丸那里剜來的兩顆輪回眼戴上，從而避免了被拖進無限月讀世界的下場。
大筒木輝夜隨即對長生展開追殺，長生剛與大蛇丸生死大戰了一場，幾近于油盡燈枯，憑借輪回眼的瞳力，將刀術與引力相結合，在輝夜的殺招之下勉強自保逃亡，生死關頭時，六道仙人現身，以自身魂飛魄散作為代價，暫時將輝夜困住。
六道仙人的殘余意識向長生表達了他的悔恨愧疚，長生要的哪里是他的道歉，讓六道仙人趕緊將自己的本體從異空間放出來，如果把他擁有一只長生眼瞳力的本體放出來，還是有可能擊敗輝夜的。
可是，六道仙人當年封印長生本體的手段太狠了，狠到就算他如今想把長生本體放出來也無能為力。
眼看輝夜即將掙扎六道仙人的困阻，長生決定自謀生路，不顧一切飛到月球上面，月球因為輝夜解封的緣故，生活在上面近一千年的大筒木分家成員統統都感到絕望恐懼，長生將他們供奉在神殿中的巨型轉生眼奪走，與自身的輪回眼融合形成新的長生眼。
長生運用長生眼的瞳力進入不可視世界當中，尋找到封印著他本體的那片異空間，再施展金輪轉生爆，與本體里應外合，一舉擊潰封印著本體的那顆小六道地爆天星。
長生本體脫困，與化身合二為一，擁有兩顆完整的長生眼，一步邁出空間破碎瞬間來到忍界當中，與輝夜展開世紀性大決戰。
輝夜將長生拖入異空間中戰斗，最終仍是不敵擁有兩顆完整長生眼的長生，被長生徹底斬殺。
兩顆長生眼湊齊之后，長生還覺醒出一個復活忍術，長生憑借長生眼中無窮無盡的生機力量，施展超輪回天生之術，將所有死在這場戰爭中的人們復活，包括自來也、綱手、旗木朔茂、邁特戴、宗鎮等人。
輝夜死后，神樹再次分化為十只尾獸，長生將八只尾獸連同外道魔像，統統封印到九喇嘛體內，九喇嘛自此長出第十根尾巴，成為真正意義上的十尾。
此外長生還打通人間與冥界的通道，讓死去的亡靈（諸如柱間、扉間、日向天忍、猿飛佐助）都能自由往返人間與冥界兩界之間，活著的人與死去的人自此心意相通不再有遺憾。
這一場驚世變故發生過后，長生蒙面俠的身份徹底暴露，為世人所知，世人都將長生奉為比肩六道仙人的偉大存在。
此后幾年過去，自來也在忍校中發現了波風水門這個好苗子，將他收做自己的親傳弟子，水門一年一年的張大，漸漸到了適婚的年紀，自來也又做起媒人生意，本著肥水不流外人田的想法，將玖辛奈介紹給水門，沒想到兩人一拍即合相互看中。
又過了幾年，水門入贅到渦之國，正式與玖辛奈成婚，成婚當年，玖辛奈誕下一子，將其取名為旋渦鳴人，水門成為渦潮村的第四代渦影。
同年，宇智波鏡的孫子宇智波富岳也與宇智波美琴成婚，生下次子，宇智波富岳因為仰慕日斬他爹的威名，便將自己的次子取名為宇智波佐助，據說日斬得知此事后氣的吹胡子瞪眼，要來找宇智波富岳算賬，想了想又覺得自己以大欺小很沒有面子，此事就這樣算了。
出乎所有人預料，長生居然親自收徒，將漩渦鳴人和宇智波佐助收做自己的親傳弟子，自來也得知后十分吃味，心想自己身為長生的養子，都沒那福氣當長生弟子，漩渦鳴人和宇智波佐助兩個小崽子剛一出生就有這種待遇，讓自來也感到心理不平衡，郁悶了好長一段時間。
長生從小開始教導鳴人和佐助，鳴人和佐助一邊相互競爭一邊成長，轉眼十七年過去。
在這期間，宗鎮退位，自來也繼任木葉的四代目火影，旗木朔茂繼任云隱村的五代目雷影，加藤斷繼任巖隱村的三代目土影，夕陽真紅繼任霧隱村的四代目水影。
值得一提的是，旗木朔茂的兒子旗木卡卡西，由于過于崇拜蒙面俠的緣故，也學著蒙面俠在自己臉上蒙了一塊布，每時每刻都不拆下面紗。
長壽從渦之國大名寶座上退下，膝下無子的他，讓妹妹的兒子長門繼任渦之國大名。
十七年過后，經過長生的悉心教導，鳴人和佐助的實力都已成長到超影層次，但由于他們多年前從忍校畢業后都沒有參加中忍考試的緣故，他們兩人在木葉的忍者檔案里，都還只是下忍身份。
這一年，學有所成的鳴人與佐助都來參加這一屆中忍考試。