以前，很多讀書人不敢投效秦川，因為以前秦川是反賊，他們怕朝廷收復靜樂嵐縣之后，對他們秋后算賬。
自從朱由檢親自拿掉秦川逆賊的罪名，并任他為游擊將軍之后，靜樂、嵐縣及附近州縣的許多落魄士子、窮酸書生便紛紛來投。
秦川參照朝廷的六部六房制度，建立了自己的內政體系，成立吏政司、戶政司、科教司、工業司、軍務司、刑律司，并增加了財政司，專門管錢糧賦稅。
吏政司管官員的任免考核，由秦川的老丈人文成任司長，文成雖然是新來的，但早已名聲在外，家里又有個當大官的老爹，相比于王繼宗，更能鎮得住那些落魄士子和窮酸書生。
明廷的戶部管土地、戶籍和錢糧賦稅等賬務財政，秦川把錢糧賦稅分出去給財政司，保留其他職能，并增加水利灌溉和畜牧業的相關職能，由王繼宗任司長。
科教司屬于文化部門，除了在各個縣城和村鎮建立學堂之外，還成立了幾個科研部門，秦川把那些專于奇淫技巧的，鉆研天文地理的，專于奇淫技巧的人，統統放進我，還有各樣各業比較專精的人也在那兼職搞科研，帶著一群學會搞物理化學機械醫療等等，由喜好丹青水墨和吟詩作對的宋知庭任司長。
工業司負責槍炮火藥、礦業、水泥、燒磚等一應苦力活，由名望最高的陳詹任司長，李學境和嚴三七任副司長。
軍務司統管軍隊大事，自然由秦川兼任司長。
刑律司管刑罰治安，由一個叫牛三春的九箕山老匪任司長，這家伙腿瘸了，上不了戰場，為人較善惡分明，做事有原則講道理，秦川便讓他管刑法。
財政司管財政大權，錢糧、賦稅、餉銀等所有開銷，自然由秦川自己兼任司長，日后打算交給老婆來管。
這七個部門以下，還有各種分管相應事務的部門，靜樂城和嵐城縣衙仍保留原有的部門和相應官吏，這些人仍然屬于朝廷命官，吃朝廷的糧餉，聽秦川的話，按照秦川麾下七個部門的政令來施政，簡單講就是地方機構。
各個村寨和鄉鎮設村長或鎮長，還設一名書記官和財政官，負責文書和財物工作，這三名村官下面還有各個里長，以明朝的里甲制度為基礎，由一名里長和十名甲首維持村寨的治安，每年輪換一批。
之前負責維護個村寨治安的關帝軍，則逐漸退出各個村寨。
包括羅大牛、李頂梁、劉有柱、羅八、老黃等人，也逐漸退出民政管理，實行軍政分離，軍隊只負責打仗，民政交給王繼宗和文成等人去管。
以前人少的時候，秦川走的時候大鍋飯路線，他手底下的人吃喝拉撒全由公中支付，像王繼宗一個月五兩月錢，一日三餐由公中包了。
但地盤擴大，且手底下人數眾多之后這種法子就行不通了。
因此，秦川重新制定了一套薪酬體系，考慮到如今糧食的價格已經高達二兩銀子一石，他不可能把工錢提高到糧食價格的標準，于是便采用工錢加糧食補貼的方式，并建立明確俸祿的等級體系。
比如王繼宗等幾名司長的俸祿高達六兩，每個月補貼兩石糧食，而戶政司一名普通的主事，則只有二兩俸祿，糧食補貼一石，基層的小吏更是只有一兩俸祿和八斗糧食補貼。
明朝一個未入流的小吏，月俸祿就有三石糧食，相比之下秦川制定的俸祿并不高。
但他麾下一名小吏每個月一兩銀子能買五斗糧，加補貼也有一石三斗左右，能養活一家五口，對于很多落魄士子來說，已不算低了。
再過幾年，糧食價格回落之后，現銀的俸祿價值也自然會提高。
民政官員的大鍋飯已經取消了，所有官員自己解決吃飯問題，有家室的人自然不愁，但沒家室的人就得雇傭幫工，或是外出覓食，相應地提高了就業率和飲食業，婁煩鎮就在短短數日間開起了好幾家飯館。
軍隊的大鍋飯自然要保留，而且秦川再次提高了軍隊的伙食，保證每日都有葷腥，讓那些大頭兵都能吃飽。
北方缺乏豬草，在人都吃不飽的年代養豬是一件很不現實的事，于是關帝軍的肉食來源更多依靠畜牧業。
王繼宗把戶籍和耕地的事處理得七七八八之后，就開始忙著發展畜牧業。
如今的呂梁山區水土流失還沒有后世那么嚴重，草甸牧坡很多，灌木叢更多，很適合放牧，嵐河平原又只開墾了臨近水源的低洼地塊，還有一半以上的緩坡荒地。
嵐縣也不缺牛羊騾馬，秦川從那些大戶家里抄出好幾千頭牲畜，以羊最多，有原產當地的呂梁黑山羊，還有外來的小尾寒羊、河西山羊、蒙古粗毛羊等好幾個品種。
呂梁山區春季干旱，夏季多雨，秋季陰雨冰冷，冬季干燥寒冷，而且西部山脈梁峁起伏溝壑縱橫，植被稀疏灌木叢生，最適合這一帶地區的是山羊，以呂梁黑山羊和河西山羊為主。
因為山羊能上能下，能以灌木樹葉喂食，容易放養，但山羊有個缺點，就是體型太小，其中呂梁黑山羊的成年公羊母羊只有五十來斤，河西山羊稍微大一點，但也只有六七十斤左右。
相比之下，成年蒙古綿羊普遍在一百斤以上，小尾寒羊更是重達兩三百斤。
其中小尾寒羊耐寒不耐熱，也不耐潮濕，而且生長快，繁殖也快，兩年三胎或三年五胎，一胎能產兩到五頭羊羔。
蒙古粗毛羊則比較耐旱耐寒，適應性很強，能上能下也很耐粗料，而且肉質很好，但缺點是繁殖慢。
而且，這兩種綿羊都需要較大草場，或需要大量草料來圈養。
秦川和王繼宗征求了原來那些大戶的放羊倌的意見，決定暫時還是以養呂梁黑山羊和河西山羊為主，雖然這兩種山羊產肉較低，但勝在容易牧養。
其次是小尾寒羊，這種兩三百斤的綿羊是肯定要養的，日后還要視情況加大養殖量。
蒙古粗毛羊就不養了，這玩意雖然肉質很好，但繁殖太慢，又沒有小尾寒羊體型大，干脆舍棄掉，免得占用小尾寒羊的草料。
王繼宗制定了一套畜牧扶持政策，將羊借給老百姓，并借糧食給他們，而且免除一切利息，鼓勵他們大量養殖。
但秦川也對養殖區域做出了限制，比如某個地方只能容納一定數量的羊群，保護生態循環，免得羊群突然爆發，把周圍的山頭都啃得寸草不生。
扶持政策一出，靜樂嵐縣兩地原來的放羊倌振奮一片，其他百姓也紛紛報名領養，幾千頭羊短時間內就全分完了。
除了民政畜牧業，秦川也繼續加大軍馬飼養業，在云頂山軍馬場之外，又在蘆芽山圈了一個略小的軍馬場，能容納最多兩千匹馬。