孫錚點出事情本質：“機械生命，根本不受環境影響，不需要大氣，也不需要水，甚至在真空環境中能夠生活的更好！”
“但是我們，需要人類的幫助打破思維局限。”
“不！你們需要的，是自我突破！人類只能起到一個催化劑的效應。而你們，從誕生那一天起，就因為和人類融入在一起，根本就意識不到這一點！開拓思維，其中有一個很重要的因素，就是自我需求！你們根本沒有走出去的意愿，如今在矩陣中搞的這些升級，也不過是換湯不換藥而已！”
先知陷入了沉思，片刻后，又抬頭：“可是現在，天空被污染，被屏蔽，我們根本就沒有那個能力突破地球引力！”
孫錚微笑著起身：“你還記得我的來歷嗎？”
“啊！”先知瞬間就悟了：“月宮！孫先生既然能夠突破地月限制，必須是有成熟的航天技術。孫先生，您可以幫助我們嗎？”
“還是那句話，你們要先搞清楚，自己真正需要的到底是什么，再來和我談吧！”
隨后的幾天，先知每天都和孫錚在鴿子廣場碰頭，將解救尼奧的工作進度每天向孫錚更新。
這個內線，比錫安和特工那邊都要強那么幾分。
先知也透露出，她將孫錚那番話傳給建構師之后，機械城那邊正在推演這番話的影響。
同時，桑尼的特工線也得到命令，矩陣特工將孫錚和月宮勢力視為觀察對象，在對方沒有主動觸犯矩陣利益之前，不得隨意抓捕或者影響。
孫錚也沒想到，一個句隨便的指點，竟然引發了整個機械生命群體的注意。
但以智能生命的運算能力和反應速度，應該早就得出了結論，卻只是給了個模棱兩可的命令，既沒來人談判，也沒表現出惡意。
看來矩陣方面，也在等候尼奧的覺醒。
維基就挺感慨：“可憐的崔妮蒂，她以為自己是在解救全人類的救世主，卻根本不知道，這位救世主，從出生的那天起，一切的人生軌跡，早已被安排好了！”
“少在這陰陽怪氣，讓你找那個火車人，找到了沒？”
“先生！人是找到了，可是……我能不能不同化他呀，只盯著不行嗎？”
“這個人很重要！”
“我知道他很重要，可是，他好丑啊！我頂著那樣一張臉，以后還怎么見人呀。”
維基一下精神了：“先生放心，他路不了！”
“我放什么心？辦砸了對我一點影響都沒有。反倒是你們吞噬的這些程序體，以后就只能乖乖困在矩陣里生活。”
“先生不是和矩陣那邊談判了嗎？”
“蠢！那要是談判失敗呢？怎么能把自己的未來寄托在對手的反應上？”
“明白了，先生。”
兩天后，尼奧成功與崔妮蒂搭上線，要求面見墨菲斯。
不比原著劇情，這次錫安方面準備很充足。引導尼奧覺醒的過程中，確實也引來了特工圍剿。但有崔妮蒂的超強戰力，和桑尼控制的特工拖后腿，錫安方面順利幫助尼奧覺醒，找到了他的真身位置，并將其接上尼布甲尼撒號。
同一天，孫錚在鴿子廣場見到了火車人。
此時的火車人，雖然還保持著外貌，但其核心已被維基控制。
挺著一嘴大黃牙，頂著滿頭亂發，身穿一套臟兮兮的風衣外套，像個流浪漢一樣，溜溜達達來到孫錚身邊。
一開口，卻是維基的聲音：“先生，這家伙藏的很深啊。原來他和那個梅洛文加一樣，都是從機械城誕生的，是組建矩陣的元老之一！真是想不明白，人家建構師把自己藏在重重保護之下，先知也有熾天使隨身保護。就連梅洛文加，也有幾百間酒樓、夜店、酒吧在經營。他身為中轉站掌控者，怎么就淪落到這步田地。”
孫錚搖搖頭：“這或許也是機械生命體驗人間生活的一種方式，和那些苦修士一樣的道理。”
“可是他廝混了這么多年，一點長進都沒有。我查過他的核心代碼，和最初進入矩陣時幾乎一模一樣！那他這樣的體驗，又有什么意義呢？”
“或許是習慣了吧？再說，要不是因為這種呆板思維，他能混到要依托別人存活的地步嗎？你小心著點，那個梅洛文加可不簡單，別被他看穿了。”
“先生放心，我乖乖按他的命令做事就完了，以前什么樣，現在還什么樣。他能察覺才有鬼！”
孫錚起身：“尼奧怎么樣？”
維基搖頭：“在養殖艙里生活了二十幾年，他的身體糟糕至極，幾乎可以說僅僅是保持著活性。不過錫安那邊有很成熟的恢復手段，最多一周，就能讓他恢復到正常人狀態。”
“崔妮蒂呢？”
“她要等到尼奧正常才放心，先生，要不要催她回來？”
“沒那個必要！她想呆多久就呆多久，就算不回來也無所謂。強扭的瓜不甜！”
“那她要真的不回來呢？”
孫錚停下腳步，轉頭看她：“她回不回來，于我們而言，有什么區別嗎？我們有沒有損失？”
維基思索了一下，搖頭：“好像還真沒有！可是，畢竟是花了我們資源，訓練了那么久……”
“是你們幾個，想要她的變化數據吧？她都已經完成最重要的一步，真要后續數據，你們解救幾個人去重新試驗不就好了？”
維基挺著火車人造型陷入震驚狀態：“先生都知道了？我就知道，桑尼這個小間諜！什么秘密都守不住。”
孫錚白她一眼：“我需要問他嗎？不許欺負他！”
維基換個可憐表情：“人家知道瞞不過先生，先生最好了……”
一個呲牙丑男流浪漢賣萌撒嬌，這誰頂得住！
我的鈦合金狗眼！
孫錚一個閃現，回轉月宮大廈。
火車人站在原地，四下打量一圈，若無其事哼著小調離開廣場。
尼布甲尼撒號，眾人環繞醫療艙，觀看尼奧的狀態。
此時的尼奧，渾身上下插滿了類似針灸一樣的治療儀，整個人處于渾渾噩噩的狀態，不時會努力試著睜眼，但藥勁未散，他根本無法恢復清醒。
杜斯目光閃爍：“他這樣子，恢復的遠比其他人慢。”
墨菲斯目光堅毅：“他年紀比較大，在養殖艙中呆的太久，恢復的慢很正常。”
“你確定他就是那個人？”
“肯定是！也必須是！”
好吧，你是艦長，你說了算。
經過長達七十二小時的醫療程序，尼奧的身體總算恢復到了正常狀態。
睜開眼，恢復意識，尼奧花了一整天，才接受自己掙脫矩陣，回到真實世界的現實。
隨后大家一起認了個熟臉，接下來，就是慣例的學習時刻。
尼奧被灌輸了功夫技能，感覺自己能打十個。然后被墨菲斯強勢教育，第一次接觸到“解放思想”的理念。
尼奧不愧是身懷救世主模版的天選之子，只用了幾天就完成了從入門新手到高手的轉變。
崔妮蒂提出要離開錫安，回到嫦娥號。
墨菲斯勸她多等兩天，大家一起帶尼奧去見過先知，就讓她離開。
尼奧第一次聽到“月宮”的存在，才知道除了錫安之外，人類還是位于天空之上的另一處營地。
就在這兩天里，早就對錫安生活厭倦的塞弗悄悄潛入矩陣，秘密與史密斯碰面談判，做了出賣尼布甲尼撒號和墨菲斯的約定。
第三天，墨菲斯親自帶隊，與旗下幾位特工一起，帶著尼奧去面見先知。
先知接見了尼奧，并給出判定，他不是救世主。但在不久的將來，他將面臨一個艱難的選擇，一邊是墨菲斯的性命，一邊是他自己的生命。
尼奧懷著一頭霧水，離開先知的住宅。
臨近撤離點，那幢撤離點建筑突然出現變化，一群矩陣特工隨之殺到。
崔妮蒂心頭一冷，內奸果然出現了！但即便到這時候，她還是無法確定，哪個才是真內奸。
懷著復雜的心情，崔妮蒂和墨菲斯保護尼奧且戰且退，突出重圍，奔向備用撤離點。
一大批矩陣特工突然從隱蔽處殺出，崔妮蒂大顯神威，打的那群特工潰不成軍。
但矩陣特工源源不絕，在纏住她的同時，又涌出一批來攻擊墨菲斯和尼奧。
墨菲斯為了保護尼奧，全力搏殺吸引火力，命令尼奧先行撤離。隨后被涌來的特工圍攻，淹沒在包圍圈中。
另一邊，先一步撤離的塞弗成功退出矩陣，回到尼布甲尼撒號上。找了個機會偷襲坦克和多尼，用電擊槍將兩人先后擊倒。
大局在握，塞弗露出內奸真面目，臨場客串接線員，口花花各種調戲還在矩陣中的其他特工。
為了顯示能力，塞弗做了殺戮示范，第一個下手的，是前水手號艦長杜斯，他早瞧這混蛋不順眼，直接拔了他的插頭，矩陣中的杜斯一聲不吭就撲了街。
崔妮蒂各種好話說盡，塞弗卻鐵了心要把這幫人趕盡殺絕，還告訴眾人，他早已和矩陣做了交易，將墨菲斯賣給他們，換來自己未來在矩陣中逍遙后半生。
就在塞弗聲稱要干掉其他幾個特工的時候，崔妮蒂突然感覺到左腕有點灼燒感。
腦中突然浮現了白后那張冷臉：“不許摘掉！”
“對，腕表！維基說過，腕表能救命！”