但是刑天軍入城之后，對普通百姓和商賈卻并不侵害，特別是對待城中普通百姓，可以說是秋毫無犯，不但如此，還發給米糧給予賑濟，幫助他們渡過這段時日，同時為城中商賈發放通行證，準其繼續在城中居留行商，并且準其在刑天軍控制區之內通行，只要照交刑天軍要求的稅金就行。
大明其實商業已經相當發達，但是怪異的卻是朝廷主要征收的卻是農業稅，依靠的也是農業稅，朝廷用度也多從農民身上搜刮，但是卻對商人很少征稅，以至于使得大明王朝的財政到了末年的時候，支出過大，以至于快陷入到政府破產的邊緣。
為此萬歷年開始，皇帝便想要對商賈們征稅，以滿足國家財政的需求，但是這件事卻受到了東林黨的極力反對，斥之為與民爭利！
其實狗屁的與民爭利！眼下大明的商賈，沒有幾個跟官府的官員們不勾結的，甚至于許多巨商背后本來就是當官的在參與甚至是直接經營，皇帝想要對商人征稅，豈不是等于要向從這些當官的口袋里面掏錢嗎？這可如何了得？于是東林黨的這些所謂的國家精英和棟梁們豈會答應？即便是他們明知國家需要這么做，但是為了個人的私利，他們還是立即開始群起而攻之，什么國家利益！狗屁，都比不上他們朝腰包里面撈錢重要！最終在東林黨的阻擊之下，使朝廷試圖對商人征稅的事情最終也沒能得以推行下去！
后來到了崇禎年間之后，崇禎也天天為錢發愁，又是加遼餉，又是加剿餉，又是加練餉，結果鬧得天下農民無法生存，紛紛揭竿而起，就連一些小地主也沒法活了，最終也加入到了造反的行列之中，崇禎何曾沒有想到過朝商人征稅呀！但是朝中那些精英們便是最大的阻礙，使得崇禎有心也沒法推行，甚至他連海禁都不得不打開了，可是對商人的征稅之事，卻始終無法進行。
所以說明亡，跟東林黨這幫國之棟梁的努力也是分不開關系的，這幫所謂的精英集團，才是最大的罪魁禍首。
肖天健當然明白其中的原因，所以從他占領陽城開始，便在轄地之內，對商人征稅，稅賦定的也不算高，商人們只要想進入刑天軍轄地經商，就要交稅，不管你是誰，哪怕是肖天健的老丈人，跟刑天軍做生意，這商稅都少不了！為此他老丈人范耀山還對此事多有腹誹，可是范雨彤卻大加贊賞，最終說服了范耀山，支持肖天健這么做。
在肖天健的心中，只要是在他的轄地之內，可以有人富，可以有人窮，也可以有地主階級的存在，但是唯獨一種人不能存在，那就是特權階級，不管是誰，在他的轄地之中，就要服從他的管理，種地按畝收稅，不管你是誰，有一畝算一畝，地多的多交，地少的少交，只要一個公平二字，這樣一來，階級矛盾也就會少一些，有錢人要對國家承擔的責任更重一些，這才可以避免有朝一日重蹈大明的覆轍，所以肖天健倒不抵觸地主階級和有錢人，他關心的只是一個公平二字，只要每個人都對國家負有責任，那么不在乎誰有錢沒錢！
不過雖說是開放商賈經商，但是在刑天軍梳理過武昌府的商戶之后，還是抄了不少商戶，因為這些商戶其實暗中就是許多官吏私人的，自然也在抄沒范圍之內了！
現在好了，大家都從頭來過，公平競爭，誰能發財，那是憑借的自己的本事，他肖天健保護這樣的人，但是要靠著當官在背后撐腰，對不起，抄你沒商量，現在這些錢都充公，重新分配！
對于抓獲的這些戰俘們，其中的楚王朱華奎，因為在武昌罪惡昭彰，民憤極大，肖天健也不對他客氣，直接下令將他和他兒子拉出去砍了拉倒，一方面省的安置他們麻煩，另一方面也以此來平息民憤，招買周邊的民心。
而對于城中俘獲的那些官吏們，肖天健則下令對其甄選，挑揀出貪墨的最厲害的人，拉出武昌城干掉，同樣也是用他們的人頭收買人心之用。
但是對于低級的一些官吏和一些在武昌一帶百姓之中有清名的官吏，則寬容對待，不愿繼續為官為刑天軍做事的，釋放其回家，發還部分財產，讓其可以生活，但是處于編管之中，受委派的保長的監管生活，愿意繼續為官，為刑天軍做事的，則選他們的強項，重新進行安排，以刑天軍文吏的身份，重新啟用，使之搖身變為刑天軍的官員，為刑天軍效命。
但是不得不提一下城中的那個前任朝廷的禮部尚書、東閣大學士賀逢圣，此人乃是萬歷四十四年殿試第二名，乃是一個大才之人，為人剛正清廉，而且不喜攀附權勢，曾經得罪過魏忠賢，結果被罷官，后來崇禎年間魏忠賢倒臺之后，重新復起，剛剛致仕返鄉，便遇上刑天軍攻打武昌城，結果在武昌城破之后，被刑天軍抓了起來。
肖天健了解了賀逢圣的情況之后，親自到監押地將其釋放，并且將其家人也都發還，城中宅院財產也盡數發還，以禮待之，想要請他出山為官，但是當即便遭到了賀逢圣的斷然拒絕，并且肖天健還被他痛罵了一頓。
為此肖天健和賀逢圣還進行了好一通的理論，歷數當今朝廷的種種不是，但是卻被賀逢圣一一反駁，對于這樣的大儒之人，肖天健耍嘴皮子跟他斗嘴，顯然是自取其辱，賀逢圣引經據典的將肖天健罵的狗血噴頭，氣的肖天健幾欲想要拔刀把這老家伙給剁了，但是最終都忍住了怒氣，繼續和他理論，但是最終還是落敗而逃。
但是肖天健卻還是不許任何人對這個老頭子無禮，下令手下給賀家提供城中最好的飲食，善加對待。
可是賀逢圣卻有點死腦筋，眼看大明要完蛋，覺得他曾經身為朝廷重臣，不能以身侍賊，所以要在家中懸梁自盡。
而賀逢圣在原來的歷史之中，也是在張獻忠攻克武昌城之后，讓家人駕船載著他行至湖上，最終投湖而死的，可是這一次他卻沒有死成，被家人給勸救了下來。
肖天健聞訊之后，立即又趕赴賀逢圣家中探望，溫言相勸，告訴他如果他不想投降刑天軍，給他肖天健做事的話，盡可安生在家做一個平民，他肖天健絕不會逼迫他出來做官的，而且保證善待他的家人，并且一定善待百姓，這才讓賀逢圣絕了尋死的念頭，從此之后閉門不出，徹底當了個閑人。
不過在數年之后，賀逢圣還是再一次以近六十歲的高齡在肖天健的朝中出仕，當了一個修史館的總編纂，主持刑天軍自成軍之后的編史之事，居然還毫不客氣的在所編的史書之中，記錄下了刑天軍的一些劣跡和肖天健的一些惡行，為此招致朝野的一片彈劾之聲，老頭子的家幾次被人丟入了大糞，險一險房子都被人給點了！
但是肖天健對這個老頭子，卻還是寬以對待，親自下令刊發了他所編著的史書，并將他所收編入書中的許多有關他的壞話也留了下來，不加一字修改，使得這個老先生致死都不得不嘆服肖天健的心胸之寬廣，含笑而去。