郭藥師過河后，立即攻取滑州，接著率騎兵先遣部隊緊隨何灌之后，一路追擊。等郭藥師追至氾水，何灌之兵又望風驚潰。何灌無奈，只好率剩余兵馬退還至京師。
何灌入城請求覲見，欲稟報梁方平逃跑之事。由于朝廷當時正處于紛亂之際，根本顧不上追查黃河失守之事。宋欽宗也沒時間見他，只是令他控守京城西隅。
金兵渡過氾水之后，擊鼓而壯行，浩浩蕩蕩，氣勢震天，大隊騎兵勁旅朝著東京城奔襲而來。沿途府縣紛紛派人火速入京稟報，“中外震動”。
宋欽宗獲報后，為應對非常之變，立即對領導機構作了調整。首先撤銷親征行營使一職，改任李綱為御營京城四壁守御使。接著免去白時中太宰職務，任命李邦彥為太宰兼門下侍郎，張邦昌為少宰兼中書侍郎，趙野為門下侍郎，王孝迪為中書侍郎，蔡懋為尚書左丞、同知樞密院事。吳敏繼續擔任樞密院使，耿南仲由簽書樞密院事升遷為尚書左丞。
同時，宋欽宗向全國諸路各派出一名身邊內侍，讓他們代表朝廷，督促諸路帥臣，趕緊率勤王之兵入京增援。
從正月初五宋欽宗御臨宣德樓那天開始，李綱正式受命，全面負責部署東京城防務。他深知自己肩負重任，不敢有絲毫怠慢。他采用百步法分兵，將外城城墻分為東西南北四個防區，每一防區派出一萬兩千余人作為正面作戰部隊，另外還配有保甲、民兵、廂軍等輔助隊伍。對這四個防區，李綱各安排一名皇帝宗室成員與一名武臣共同擔任防區提舉官，又各安排一名皇帝侍從官進行督察。各個城門是防御重點，李綱皆派遣宦官擔任使臣，按職務大小“分地而守”。
同時，李綱下令全城軍民積極行動起來，全面開展備戰，修樓櫓，掛氈幕，安炮座，設弩床，運磚石，施燎炬，垂檑木，備火油，凡是防守所需之器械，都做了充分準備。
另外，李綱還迅速召集了馬軍與步軍四萬余人，將他們分為前后左右中五軍，每軍八千人，并建立了統制、統領、將領、隊將等組織體系，每天進行軍事訓練，以提高軍事素質和戰斗力。
李綱安排前軍駐扎在通津門外，以保護城內糧倉延豐倉，倉庫里有豆粟四十余萬石。后來勤王之師集結于東京城外，多虧有這批糧食做軍糧。后軍駐扎在朝陽門外，控制樊家岡一帶較淺的濠河，使敵人騎兵不敢接近城墻。而左、右、中軍都駐扎在城中，作為戰略預備隊，以備緩急之用。
東京城作為首都，是北宋的政治、經濟、文化中心，也是軍事重地。東京城由外城、內城和宮城三部分組成，城防工事主要分布在外城，而且修筑得很堅固。外城四面城門共有14座，其中水門有7座。各水門跨河設有鐵柵閘門，每到晚上，都要放閘閉門，以防敵人沿河潛入城內。城門是交通運輸的主要出入口，也是防守與出擊的重點。每座城門口都設置有圓形或方形的甕城，以加強城門入口的防護。甕城之上設有戰棚，供守城士兵防御和休息之用。外城城墻每隔六七十步設有一座馬面，馬面突出于城墻之外，可以交叉射擊，保護城墻不受敵軍破壞。大約每隔二百米設有一座庫房，內藏各種武器和軍需品。為加強城防，在外城周圍還開挖了一條護城河，河兩岸栽有榆樹柳樹，也能給攻城敵軍構成障礙。
正在全城軍民積極備戰之際，太學生陳東忽然又上書。他上書不是建言如何抗擊金兵，如何保衛東京。他關注的不是外患，而是內憂。他在奏章中說：“臣竊知上皇已幸亳社，蔡京、朱勔父子及童貫等統兵二萬從行。臣深慮此數賊遂引上皇迤邐南渡，萬一變生，實可寒心。蓋東南之地，沃壤數千里，其監司、州縣官，率皆數賊門生，一時奸雄豪強及市井惡少，無不附之。近除發運使宋煥，是京子攸妻黨。貫昨討方寇，市恩亦眾，兼聞私養死士，自為之備。臣竊恐數賊南渡之后，假上皇之威，振臂一呼，群惡響應，離間陛下父子，事必有至難言者。望速追數賊，悉正典刑，別選忠信可委之人，扈從上皇如亳，庶全陛下父子之恩，以安宗廟。”
陳東的擔憂不能說沒有道理。當時，不僅童貫率三千勝捷軍追隨宋徽宗南下，而且，高俅也帶領三千禁衛軍出城追趕宋徽宗而去，二人為爭當宋徽宗扈從差點打了起來。
陳東這份奏章說出了一部分大臣的心中所憂，也說到了宋欽宗隱隱不安的心坎上。宋欽宗閱后“然之”。但宋欽宗心里清楚，眼下還顧不上處理這些內憂問題，金軍即將兵臨城下，當務之急是解決外患問題。
正月初七，宗望率金軍騎兵到達東京城外。他們沒立刻展開攻城，而是直奔京城西北郊，搶占一個名叫牟駝岡的地方，并在那里安營扎寨。
牟駝岡乃北宋天駟監即孳生馬監之所，就是養馬的一個地方，那里養有兩萬余匹馬，庫房里的糧草飼料更是堆積如山。而且，那里地勢險峻，三面環水，如同沙洲，背靠霧澤陂可作屏障。占據此地，易守而難攻。
搶占牟駝岡，很顯然是郭藥師建議并引導而去的。幾年前，郭藥師來東京覲見宋徽宗時，宋徽宗曾安排人陪郭藥師在此打過幾場馬球，所以，他對那里的情況比較熟悉。金軍占據此地可謂一舉兩得，一得地利，二得軍需，為即將進行的攻城戰打下了良好的物質基礎。
這天，東京城內所有城門全部關閉，全城實行戒嚴，守城官兵在各自陣地上嚴陣以待。而城外，方圓數百里之內，百姓紛紛離家逃難。有些不法之徒便趁亂結伙為盜，在路上攔截搶劫，有的甚至還詐裝成金人。在城門關閉前，有數萬居民從東水門跑出城去，他們扶老攜幼，沿著汴河而跑，不幸遇到這些歹徒們的襲擊，“殺掠者幾半”。歹徒們在城外放火焚燒房屋，光焰燭天，連夜不止。城里的人以為那是金人干的，所以都很恐懼。